Pandemia hasi zenetik, diagnostiko-probak funtsezko eginkizuna izan dute SARS-CoV-2, eragiten duen birusaren hedapena kontrolatzeko.COVID 19.Antigeno-proba azkarraketxean edo ingurune klinikoan egindako emaitzak 15 minutu edo gutxiagotan ematen ditu.Zenbat eta lehenago diagnostikatu pertsona bati, orduan eta azkarrago eskatuko du arreta medikoa eta besteengandik isolatu.Baina birusaren aldaera berriak agertzen direnean, baliteke proba horiek aldaera horiek ez detektatzea.
Antigeno-proba azkar gehienak SARS-CoV-2 nukleokapsid proteina edo N-proteina detektatzeko diseinatuta daude.Proteina hau ugari aurkitzen da partikula biraletan eta kutsatutako pertsonengan.Azterketa azkarreko kitnormalean, bi antigorputz diagnostiko ezberdin izan ohi dituzte, N proteinaren atal ezberdinetara lotzen direnak.Lagin batean antigorputz bat N proteinari lotzen zaionean, koloretako marra bat edo beste seinale bat agertzen da proba-kitean, infekzio bat adieraziz.
N proteina 419 aminoazido egitura-unitatez osatuta dago.Horietako edozein beste aminoazido batez ordezkatu daiteke mutazioaren bidez.Doktoreak zuzendutako ikerketa taldea.Emory Unibertsitateko Philip Frank eta Eric Ortlund-ek aminoazido-aldaketa bakar horrek antigeno-proba azkar baten errendimenduan nola eragiten duen ikertu nahi izan zuten.Deep mutation scanning izeneko teknika erabili zuten birusaren N proteinaren mutazio bakoitzak diagnostiko antigorputz bati lotzeari nola eragiten dion aldi berean ebaluatzeko.Euren emaitzak Cell-en argitaratu ziren 2022ko irailaren 15ean.
Ikertzaileek ia 8.000 N proteina mutazioko liburutegi integral bat sortu zuten.Aldaera hauek mutazio posible guztien % 99,5 baino gehiago hartzen dute.Ondoren, aldaera bakoitzak merkataritzan eskuragarri dauden 11 antigeno test azkarretan erabilitako 17 antigorputz diagnostiko ezberdinekin nola elkarreragiten zuen ebaluatu zuten, ohikoak barne.etxeko kitak.
Taldeak ebaluatu du zein N-proteinen mutaziok eragiten duten antigorputzen aitorpena.Informazio horretatik abiatuta, diagnostiko antigorputz bakoitzeko "ihes-mutazio profila" sortu zuten.Profil honek N proteinaren mutazio espezifikoak identifikatzen ditu, antigorputzak bere xedera lotzeko duen gaitasunari eragin diezaiokeen.Azterketak erakutsi zuen gaur egungo proba azkarretan erabiltzen diren antigorputzak kezkatzen eta kezkatzen dituen SARS-CoV-2ren iraganeko eta oraingo aldaera guztiak ezagutzen eta lotzen dituela.
Diagnostikoko hainbat antigorputzek N proteinaren eskualde bera ezagutzen badute ere, ikertzaileek aurkitu dute antigorputz bakoitzak ihes-mutazioen sinadura berezia duela.SARS-CoV-2 birusak mutatzen eta aldaera berriak sortzen jarraitzen duen heinean, datu hauek berrikusi behar diren proba-kitaren antigorputzak markatzeko erabil daitezke.
"Kutsatutako pertsonen identifikazio zehatza eta eraginkorra COVID-19 arintzeko estrategia kritikoa izaten jarraitzen du, eta gure azterketak detekzioa oztopatu dezaketen SARS-CoV-2 mutazioei buruzko informazioa eskaintzen du", esan du Ortlundek."Hemen azaltzen diren emaitzek birus honetara azkar egokitzeko aukera ematen dute aldaera berriak sortzen jarraitzen duten heinean, berehalako ondorio klinikoak eta osasun publikoak aurkeztuz".
Aurrekariak: Mutation Deep Scan SARS-CoV-2 nukleokapsidean ihes-mutazioak detektatzen ditu gaur egun eskuragarri dauden antigeno-proba azkarrak erabiliz.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022ko irailaren 15a;185(19):3603-3616.e13.Barne Ministerioa: 10.1016/j.cell.2022.08.010.2022ko abuztuaren 29a PMID: 36084631.
Finantziazioa: National Institute for Biomedical Imaging and Bioingeniering NIH (NIBIB), National Institute of Diabetes, Digestive and Kidney Diseases (NIDDK) eta National Institute of Alergy and Infectious Diseases (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters NIHko adituek berrikusitako NIH ikerketaren aurkikuntzen astero eguneratzea da.Osasun Institutu Nazionaleko zuzendariaren Komunikazio eta Gai Publikoen Bulegoak argitaratu du.